Село Подойниково расположено в Панкрушихинском районе в северо-западной части Алтайского края в 274 километрах от Барнаула. До ближайшей железно­до­рож­ной станции Панкрушиха 20 кило­метров. По территории села прохо­дит трасса Барнаул - Камень-на-Оби - Славгород. Село является административным центром Подойниковского сельсовета, в который входят с. Высокая Грива, с. Конёво, п. Первомайский и ст. Световская. Сельсовет возглавляет Олег Иванович Сафронов.

Рельеф – слабоволнистая равнина. Село расположено в ложбине древнего стока, днище которой занято песчаными отло­жениями, частично преобра­зован­ными ветровыми процессами и отли­чающимися бугристо-грядовым рельефом. Климат континентальный, характеризуется мороз­ной продолжительной зимой (средняя температура января -18,7°C) и теплым летом (средняя температура июля +22°C).

Белка - частый гость в селе

Село Подойниково находится на левобережье реки Бурлы, которая вытекает из озера Пустынное в Крутихинском районе и впадает в горько-солёное озеро Большое Топольное в Бурлинском районе. В реке обитают: щука, карась, окунь, чебак. В селе и его окрестностях распо­ложены озёра: Байкал, Епишкино, Кормовище, Цветуха, Старинка, Русаки и др. Почвы – чернозёмы, среднесуглинистые, дерново-подзо­листые, супесчаные, редко солонцеватые. По характеру растительного покрова село относится к лесостепной части Приобской подзоны.

Алеусско - Бурлинский ленточный бор - уникальный памятник природы

Алеусско - Бурлинская лента реликтовых алтайских боров, рядом с которой располагается село, - это массивы Панкрушихинского лесхоза (ныне ООО "Алеусский лес"). Бор защи­ща­ет землю от суховеев степи, способствует сохра­не­нию влаги в почве и предохраняет её от выветри­ва­ния. Здесь встречаются берёза, осина, листвен­ница, осина, черёмуха, ива, тополь, жёлтая акация, но до 80% бора занимает сосна. В окрест­ностях села расположено множество колков: берёзовых, осиново-берёзовых, осиновых. Площади между колками занимают луга, которые используются под пастбища или сенокосы. В лесах водятся: лось, косуля, рысь, волк, заяц, белка, лиса, хорёк, норка, горностай, колонок. В водоёмах встречаются ондатра, бобёр. Из птиц обитают тетерев, куропатка, косачи, глухари, рябчики, гуси, утки. Лес богат грибами и ягодами.